שְׁאֵלָה:
משאבים ללימוד רשת מרקוב ומודלים נסתרים של מרקוב
bow
2010-10-04 13:33:06 UTC
view on stackexchange narkive permalink

אני מחפש משאבים (מדריכים, ספרי לימוד, שידור אינטרנט וכו ') כדי ללמוד על שרשרת מרקוב ועל HMM. הרקע שלי הוא כביולוג וכעת אני מעורב בפרויקט הקשור לביואינפורמטיקה.

כמו כן, מה הרקע המתמטי הדרוש לי כדי שיבין מספיק את מרקוב מודלים & HMMs?

הסתכלתי סביב באמצעות גוגל, אך עד כה עדיין לא למצוא הדרכת היכרות טובה. אני בטוח שמישהו כאן יודע יותר טוב.

עליכם להפוך את ההודעה שלכם לוויקי בקהילה מכיוון שאין תשובה נכונה.
הרגע הסבתי את זה.
זה יהיה שימושי מאוד: https://web.stanford.edu/~jurafsky/slp3/A.pdf
אחת עשרה תשובות:
#1
+19
chl
2010-10-04 15:16:24 UTC
view on stackexchange narkive permalink

הנה כמה מדריכים (זמינים כקובצי PDF):

  1. דוגאד ודסאי, הדרכה על דגמי מרקוב נסתרים
  2. ולריה דה פונזו 1 , פיליפו אלופי-פנטיני 2 ולריו פריסי (2007). מודלים מרקוב מוסתרים בביואינפורמטיקה. ביואינפורמטיקה נוכחית , 2 , 49-61.
  3. סמית ', ק. מודלים מרקוב נסתרים בביואינפורמטיקה עם יישום למציאת גנים ב- DNA אנושי

עיין גם במדריכים של Bioconductor.

אני מניח שאתה רוצה משאבים בחינם; אחרת, ביואינפורמטיקה מפולנסקי וקימל (ספרינגר, 2007) מספק סקירה יפה (§2.8-2.9) ויישומים (חלק ב ').

#2
+12
M. Tibbits
2010-10-07 22:59:07 UTC
view on stackexchange narkive permalink

יש גם ספר ממש טוב מאת אוליבר קאפה וא. al: הסקה בדגמי מרקוב נסתרים. עם זאת, הוא תיאורטי למדי ומאוד קל על היישומים.

יש ספר נוסף עם דוגמאות ב- R, אבל לא יכולתי לעמוד בזה - מודלים מרקוב נסתרים לסדרות זמן.

Ps לקהילת זיהוי הדיבור יש גם המון ספרות בנושא זה.

#3
+8
Zhubarb
2013-10-09 15:18:24 UTC
view on stackexchange narkive permalink

די מפתיע לראות שאף אחת מהתשובות לא מזכירה את עבודת ההדרכה של רבינר בנושא HMM.

בעוד שהיישום המעשי (החלק האחרון של העיתון) ממוקד. בנושא זיהוי דיבור, מאמר זה הוא ככל הנראה המצוטט הנפוץ ביותר בספרות HMM, הודות לאופיו הברור והמוצג היטב. p>

#4
+5
Dikran Marsupial
2011-07-01 12:05:59 UTC
view on stackexchange narkive permalink

עבור יישומי ביואינפורמטיקה, הטקסט הקלאסי על HMM יהיה Durbin, Eddy, Krough & Michison, " אנליזה של רצף ביולוגי - מודלים הסתברותיים של חלבונים וחומצות גרעין", הוצאת אוניברסיטת קיימברידג ', 1998, ISBN 0-521-62971-3. זה טכני, אבל ברור מאוד ומצאתי שזה מאוד שימושי.

עבור MCMC יש ספר עדכני (גרסה של) מאת רוברט וקזלה, " הצגת שיטות מונטה קרלו עם R", ספרינגר, שנראה טוב, אבל עדיין לא הספקתי לקרוא אותו (משתמש ב- R לדוגמאות, שזו דרך טובה ללמוד, אבל אני צריך ללמוד R קודם; o)

#5
+5
Khader Shameer
2011-07-13 07:37:12 UTC
view on stackexchange narkive permalink

כבר הצעות נחמדות, ברצוני להוסיף את המאמרים הבאים המתארים HMM מנקודת מבט של יישום בביולוגיה מאת שון אדי.

#6
+5
thias
2011-10-06 12:48:30 UTC
view on stackexchange narkive permalink

למדתי HMM באמצעות ספר נהדר מאת וולטר קישווי ואיין ל 'מקדונלד

מודלים מרקוב מוסתרים לסדרות זמן: מבוא באמצעות R

זה ממש טוב וכולל דוגמאות ב- R.

#7
+3
Sergey
2011-07-01 11:27:39 UTC
view on stackexchange narkive permalink

התבונן בארגז הכלים (HMM) עבור Matlab מאת קווין מרפי וכן בסעיף קריאה מומלצת ב- HMM באתר זה.

אתה יכול גם להשיג ערכת כלי דוגמנות הסתברותית למטלב / אוקטבה עם כמה דוגמאות לשימוש ברשתות מרקוב וב- HMM.

ניתן למצוא הרצאות ומעבדות ב- HMM, למשל:

#9
+3
Adrian
2015-11-03 16:41:51 UTC
view on stackexchange narkive permalink

הנה כמה הערות מאת רמון ואן הנדל בפרינסטון:

קורס זה הוא מבוא לחלק מהשיטות הבסיסיות המתמטיות, הסטטיסטיות והחישוביות עבור מרקוב נסתר. מודלים.

החלק הראשון כולל מערך יישומים יפה של HMM בביולוגיה, מימון, ...

#10
+2
Galina Alperovich
2016-10-05 18:52:31 UTC
view on stackexchange narkive permalink

הנה מבוא אינטראקטיבי נחמד לרשתות מרקוב http://setosa.io/ev/markov-chains/

מכיוון שהשאלה שואלת משאבים ללימוד רשתות מרקוב, כאן מתאים קישור להדרכה - זה אחד המקרים שבהם לא היינו מצפים שתשובתך תהיה עצמאית ומנסה לסכם לחלוטין את תוכן הקישור.- אבל זה יהיה הרבה יותר טוב אם אתה יכול ללוות את הקישור עם מעט תיאור לגבי מה משאב זה מכסה, למשלבאיזו רמה הוא מוגדר (דרישות קדם מתמטיות כלשהן?) ואילו נושאים הוא מכסה.
#11
  0
Arpit Sisodia
2017-04-06 16:56:41 UTC
view on stackexchange narkive permalink

יש רק 3 סרטונים שמצאתי שהם מאוד שימושיים להבנת מתמטיקה מאחורי מודלים נסתרים של Markov-

https://www.youtube.com/watch?v=E3qrns5f3Fw
https://www.youtube.com/watch?v=cjlhpaDXihE
https://www.youtube.com/watch?v=5sGEF-e82yY

אלה ממש טובים ומלמדים על ידי אחד הפרופסורים ההודים הטובים ביותר מ- IIT krg.



שאלה ותשובה זו תורגמה אוטומטית מהשפה האנגלית.התוכן המקורי זמין ב- stackexchange, ואנו מודים לו על רישיון cc by-sa 2.0 עליו הוא מופץ.
Loading...